MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia phenoliruptrix BR3459a chromosome 2

Total Repeats: 61639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018672	GCA	2	6	116	121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708766
2	NC_018672	CCA	2	6	133	138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407708766
3	NC_018672	CTG	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708766
4	NC_018672	AAG	2	6	178	183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708766
5	NC_018672	CAGCCG	2	12	207	218	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	407708766
6	NC_018672	CGC	2	6	241	246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708766
7	NC_018672	GGC	2	6	255	260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708766
8	NC_018672	CGA	2	6	278	283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708766
9	NC_018672	GCCGAC	2	12	285	296	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	407708766
10	NC_018672	CGC	2	6	346	351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708766
11	NC_018672	CGA	2	6	374	379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708766
12	NC_018672	CGC	2	6	388	393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708766
13	NC_018672	TGA	2	6	520	525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708767
14	NC_018672	CTG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708767
15	NC_018672	CG	3	6	541	546	0 %	0 %	50 %	50 %	407708767
16	NC_018672	CGA	2	6	584	589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708767
17	NC_018672	GCA	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708767
18	NC_018672	GCT	2	6	667	672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708767
19	NC_018672	GGC	2	6	763	768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708767
20	NC_018672	CTTC	2	8	799	806	0 %	50 %	0 %	50 %	407708767
21	NC_018672	CTG	3	9	845	853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708767
22	NC_018672	GCT	2	6	889	894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708767
23	NC_018672	GTT	2	6	910	915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708767
24	NC_018672	GCC	2	6	918	923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708767
25	NC_018672	CGG	2	6	973	978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708767
26	NC_018672	CGC	2	6	980	985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708767
27	NC_018672	CG	4	8	1018	1025	0 %	0 %	50 %	50 %	407708767
28	NC_018672	CTG	2	6	1037	1042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708767
29	NC_018672	CG	3	6	1043	1048	0 %	0 %	50 %	50 %	407708767
30	NC_018672	GC	3	6	1059	1064	0 %	0 %	50 %	50 %	407708767
31	NC_018672	TCG	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708767
32	NC_018672	GGC	2	6	1151	1156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708767
33	NC_018672	TCGC	2	8	1173	1180	0 %	25 %	25 %	50 %	407708767
34	NC_018672	GCG	2	6	1188	1193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708767
35	NC_018672	TCT	2	6	1194	1199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708767
36	NC_018672	CGA	2	6	1205	1210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708767
37	NC_018672	CGC	2	6	1211	1216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708767
38	NC_018672	TCC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407708767
39	NC_018672	GGC	2	6	1280	1285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708767
40	NC_018672	GCG	2	6	1296	1301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708767
41	NC_018672	GGCG	2	8	1318	1325	0 %	0 %	75 %	25 %	407708767
42	NC_018672	TCG	2	6	1332	1337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708767
43	NC_018672	TTC	2	6	1379	1384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708767
44	NC_018672	GC	3	6	1454	1459	0 %	0 %	50 %	50 %	407708767
45	NC_018672	CGG	3	9	1462	1470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708767
46	NC_018672	CGG	2	6	1567	1572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708767
47	NC_018672	GC	3	6	1578	1583	0 %	0 %	50 %	50 %	407708767
48	NC_018672	TCG	2	6	1719	1724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708767
49	NC_018672	CGG	2	6	1729	1734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708767
50	NC_018672	GCC	2	6	1751	1756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708767
51	NC_018672	GAC	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708767
52	NC_018672	CG	4	8	1798	1805	0 %	0 %	50 %	50 %	407708767
53	NC_018672	CGG	2	6	1822	1827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708767
54	NC_018672	CGT	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708767
55	NC_018672	GCC	2	6	1912	1917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708767
56	NC_018672	CTT	2	6	1991	1996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708767
57	NC_018672	TCG	2	6	2037	2042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708767
58	NC_018672	CGT	2	6	2203	2208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708768
59	NC_018672	GAC	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708768
60	NC_018672	GAC	2	6	2235	2240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708768
61	NC_018672	CGT	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708768
62	NC_018672	GC	3	6	2267	2272	0 %	0 %	50 %	50 %	407708768
63	NC_018672	GCC	2	6	2300	2305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708768
64	NC_018672	TGC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708768
65	NC_018672	GC	3	6	2543	2548	0 %	0 %	50 %	50 %	407708768
66	NC_018672	GCT	2	6	2564	2569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708768
67	NC_018672	GTA	2	6	2601	2606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708768
68	NC_018672	GCC	2	6	2628	2633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708768
69	NC_018672	CCG	2	6	2642	2647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708768
70	NC_018672	TCG	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708768
71	NC_018672	CCG	2	6	2696	2701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708768
72	NC_018672	CGC	2	6	2711	2716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708768
73	NC_018672	CG	3	6	2768	2773	0 %	0 %	50 %	50 %	407708768
74	NC_018672	CTT	2	6	2816	2821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708768
75	NC_018672	TGA	2	6	2917	2922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708768
76	NC_018672	GAT	2	6	2987	2992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708768
77	NC_018672	GCC	2	6	3105	3110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708768
78	NC_018672	CGCGC	2	10	3111	3120	0 %	0 %	40 %	60 %	407708768
79	NC_018672	AGC	2	6	3121	3126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708768
80	NC_018672	CGCT	2	8	3159	3166	0 %	25 %	25 %	50 %	407708768
81	NC_018672	TCA	2	6	3179	3184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708768
82	NC_018672	CGA	2	6	3203	3208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708768
83	NC_018672	GCC	2	6	3210	3215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708768
84	NC_018672	TCG	2	6	3220	3225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708768
85	NC_018672	CAG	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708768
86	NC_018672	GGC	2	6	3334	3339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708768
87	NC_018672	GC	3	6	3338	3343	0 %	0 %	50 %	50 %	407708768
88	NC_018672	CG	4	8	3360	3367	0 %	0 %	50 %	50 %	407708768
89	NC_018672	ATGG	2	8	3384	3391	25 %	25 %	50 %	0 %	407708768
90	NC_018672	GCA	2	6	3395	3400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708768
91	NC_018672	GCCC	2	8	3648	3655	0 %	0 %	25 %	75 %	407708769
92	NC_018672	GGC	2	6	3699	3704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708769
93	NC_018672	CGT	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708769
94	NC_018672	CTC	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407708769
95	NC_018672	TGA	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708769
96	NC_018672	GCAG	2	8	3819	3826	25 %	0 %	50 %	25 %	407708769
97	NC_018672	GTT	2	6	3835	3840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708769
98	NC_018672	CGT	2	6	3867	3872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708769
99	NC_018672	CG	3	6	3873	3878	0 %	0 %	50 %	50 %	407708769
100	NC_018672	GC	3	6	3881	3886	0 %	0 %	50 %	50 %	407708769
101	NC_018672	ATC	2	6	3938	3943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708769
102	NC_018672	TCCA	2	8	3947	3954	25 %	25 %	0 %	50 %	407708769
103	NC_018672	CGC	2	6	3977	3982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708769
104	NC_018672	GCC	2	6	4018	4023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708769
105	NC_018672	CGG	2	6	4039	4044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708769
106	NC_018672	GCC	2	6	4063	4068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708769
107	NC_018672	CGG	2	6	4077	4082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708769
108	NC_018672	GC	4	8	4099	4106	0 %	0 %	50 %	50 %	407708769
109	NC_018672	GTC	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708769
110	NC_018672	CGG	3	9	4247	4255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708769
111	NC_018672	GC	3	6	4313	4318	0 %	0 %	50 %	50 %	407708769
112	NC_018672	GGC	2	6	4332	4337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708769
113	NC_018672	TCG	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708769
114	NC_018672	CTT	2	6	4417	4422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708769
115	NC_018672	CAT	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708769
116	NC_018672	TCG	2	6	4508	4513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708769
117	NC_018672	GCA	2	6	4539	4544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708769
118	NC_018672	GAT	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708769
119	NC_018672	GCC	2	6	4578	4583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708769
120	NC_018672	CG	3	6	4603	4608	0 %	0 %	50 %	50 %	407708769
121	NC_018672	CAG	2	6	4729	4734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708769
122	NC_018672	CCT	2	6	4812	4817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407708769
123	NC_018672	CGG	2	6	4876	4881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708769
124	NC_018672	CA	3	6	4895	4900	50 %	0 %	0 %	50 %	407708769
125	NC_018672	ATC	2	6	4988	4993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708769
126	NC_018672	TCG	2	6	5136	5141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708769
127	NC_018672	GGC	2	6	5169	5174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407708769
128	NC_018672	GCA	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708769
129	NC_018672	CGCCGT	2	12	5199	5210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407708769
130	NC_018672	TGG	2	6	5344	5349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407708770
131	NC_018672	ACG	2	6	5519	5524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708770
132	NC_018672	TGC	2	6	5615	5620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708770
133	NC_018672	TCG	2	6	5641	5646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708770
134	NC_018672	TCG	2	6	5677	5682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708770
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259	NC_018672	CCG	2	6	10884	10889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708773
260	NC_018672	AGA	2	6	10929	10934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708773
261	NC_018672	GAAG	2	8	11008	11015	50 %	0 %	50 %	0 %	407708773
262	NC_018672	CG	4	8	11020	11027	0 %	0 %	50 %	50 %	407708773
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